Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nkx1-1G3UXB3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Nkx1-1G3UXB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx1-1G3UXB3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-1G3UXB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx1-1G3UXB3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-1G3UXB3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Nkx1-1G3UXB3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx1-1G3UXB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms