Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm8334F7CD45 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gm8334F7CD45 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm8334F7CD45 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm8334F7CD45 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm8334F7CD45 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms