Protein–RNA interactions for Protein: F7AXR3

Gm17654, Predicted gene, 17654 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17654F7AXR3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm17654F7AXR3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm17654F7AXR3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm17654F7AXR3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms