Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sptbn5F6UCX4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sptbn5F6UCX4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sptbn5F6UCX4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sptbn5F6UCX4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sptbn5F6UCX4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms