Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prdm14E9Q3T6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Prdm14E9Q3T6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm14E9Q3T6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prdm14E9Q3T6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms