Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap46E9Q2C0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap46E9Q2C0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap46E9Q2C0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap46E9Q2C0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap46E9Q2C0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap46E9Q2C0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap46E9Q2C0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap46E9Q2C0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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