Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ccdc171E9Q1U1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Ccdc171E9Q1U1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc171E9Q1U1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc171E9Q1U1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc171E9Q1U1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
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