Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap20-2E9Q0A8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap20-2E9Q0A8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap20-2E9Q0A8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap20-2E9Q0A8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
Krtap20-2E9Q0A8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Krtap20-2E9Q0A8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap20-2E9Q0A8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.8 ms