Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gcom1E9PZ54 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gcom1E9PZ54 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gcom1E9PZ54 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcom1E9PZ54 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms