Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp4E9PYK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Parp4E9PYK3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp4E9PYK3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Parp4E9PYK3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp4E9PYK3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms