Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ift140E9PY46 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Ift140E9PY46 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ift140E9PY46 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Ift140E9PY46 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ift140E9PY46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Ift140E9PY46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Ift140E9PY46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Ift140E9PY46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms