Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Piezo1E2JF22 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Piezo1E2JF22 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Piezo1E2JF22 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Piezo1E2JF22 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Piezo1E2JF22 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Piezo1E2JF22 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms