Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4930558K02RikE0CXC6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4930558K02RikE0CXC6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930558K02RikE0CXC6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930558K02RikE0CXC6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
4930558K02RikE0CXC6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4930558K02RikE0CXC6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930558K02RikE0CXC6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930558K02RikE0CXC6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930558K02RikE0CXC6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4930558K02RikE0CXC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms