Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930455H04RikD3Z622 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4930455H04RikD3Z622 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930455H04RikD3Z622 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930455H04RikD3Z622 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930455H04RikD3Z622 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms