Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc78D3Z5T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc78D3Z5T1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc78D3Z5T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc78D3Z5T1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms