Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
5430403G16RikD3Z5L4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
5430403G16RikD3Z5L4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
5430403G16RikD3Z5L4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
5430403G16RikD3Z5L4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms