Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim12cD3Z3L3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim12cD3Z3L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim12cD3Z3L3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim12cD3Z3L3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim12cD3Z3L3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms