Protein–RNA interactions for Protein: D3Z257

Gm5930, Predicted gene 5930, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5930D3Z257 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5930D3Z257 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm5930D3Z257 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm5930D3Z257 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm5930D3Z257 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms