Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
4930467E23RikD3Z1P8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
4930467E23RikD3Z1P8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
4930467E23RikD3Z1P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4930467E23RikD3Z1P8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms