Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem200bD3Z0P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem200bD3Z0P8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tmem200bD3Z0P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem200bD3Z0P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms