Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pgbd5D3YZI9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pgbd5D3YZI9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pgbd5D3YZI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pgbd5D3YZI9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pgbd5D3YZI9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms