Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SafbD3YXK2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SafbD3YXK2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SafbD3YXK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SafbD3YXK2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SafbD3YXK2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SafbD3YXK2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SafbD3YXK2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SafbD3YXK2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SafbD3YXK2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SafbD3YXK2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms