Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrc5C3VPR6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrc5C3VPR6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrc5C3VPR6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrc5C3VPR6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nlrc5C3VPR6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nlrc5C3VPR6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms