Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ptprz1B9EKR1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ptprz1B9EKR1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ptprz1B9EKR1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ptprz1B9EKR1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ptprz1B9EKR1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms