Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Cttnbp2B9EJA2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Cttnbp2B9EJA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Cttnbp2B9EJA2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Cttnbp2B9EJA2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cttnbp2B9EJA2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC39.81■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Cttnbp2B9EJA2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Cttnbp2B9EJA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Cttnbp2B9EJA2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms