Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pnldc1B2RXZ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pnldc1B2RXZ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pnldc1B2RXZ1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pnldc1B2RXZ1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pnldc1B2RXZ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms