Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cspp1B2RX88 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cspp1B2RX88 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cspp1B2RX88 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cspp1B2RX88 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cspp1B2RX88 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.5 ms