Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Siah3B2RWG3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Siah3B2RWG3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Siah3B2RWG3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Siah3B2RWG3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms