Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Gm5483B2RV77 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm5483B2RV77 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm5483B2RV77 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm5483B2RV77 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm5483B2RV77 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms