Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apol7aB2RT54 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol7aB2RT54 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol7aB2RT54 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Apol7aB2RT54 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol7aB2RT54 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms