Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Herc3A6H6S0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Herc3A6H6S0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Herc3A6H6S0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Herc3A6H6S0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Herc3A6H6S0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms