Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trgv2A2J008 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trgv2A2J008 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trgv2A2J008 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trgv2A2J008 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trgv2A2J008 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms