Protein–RNA interactions for Protein: A2ARP9

Catsper2, Cation channel sperm-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper2A2ARP9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Catsper2A2ARP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Catsper2A2ARP9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Catsper2A2ARP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Catsper2A2ARP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Catsper2A2ARP9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Catsper2A2ARP9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms