Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25,73■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25,72■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,71
SktA2AQ25 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25,67■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,65■■□□□ 1,7
SktA2AQ25 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,61■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,59■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25,58■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
SktA2AQ25 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25,55■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25,53■■□□□ 1,68
SktA2AQ25 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25,5■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25,47■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25,46■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
SktA2AQ25 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28,6 ms