Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Rtf1A2AQ19 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Rtf1A2AQ19 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rtf1A2AQ19 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rtf1A2AQ19 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rtf1A2AQ19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rtf1A2AQ19 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
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