Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lcn6A2AJB9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lcn6A2AJB9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lcn6A2AJB9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lcn6A2AJB9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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