Protein–RNA interactions for Protein: A2A9C3

Szt2, KICSTOR complex protein SZT2, mousemouse

Predictions only

Length 3,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szt2A2A9C3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Szt2A2A9C3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Szt2A2A9C3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Szt2A2A9C3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Szt2A2A9C3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Szt2A2A9C3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Szt2A2A9C3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms