Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4921501E09RikA0A0R4J054 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
4921501E09RikA0A0R4J054 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
4921501E09RikA0A0R4J054 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms