Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm28510A0A087WP28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm28510A0A087WP28 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm28510A0A087WP28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm28510A0A087WP28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms