Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5T0

Ighv3-8, Immunoglobulin heavy variable V3-8 (Fragment), mousemouse

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-8A0A075B5T0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,04■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17,03■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,32
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,02■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,02■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17,01■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,01■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,99■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,98■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16,97■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16,96■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,96■□□□□ 0,31
Ighv3-8A0A075B5T0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,96■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,95■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,94■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,93■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16,92■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,92■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16,91■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,9■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,3
Ighv3-8A0A075B5T0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16,89■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16,88■□□□□ 0,29
Ighv3-8A0A075B5T0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16,88■□□□□ 0,29
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