Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP6

Gm5538, MCG67716, mousemouse

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Length 401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5538W4VSP6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Gm5538W4VSP6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5538W4VSP6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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