Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vps29Q9QZ88 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Vps29Q9QZ88 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms