Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Six6Q9QZ28 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Six6Q9QZ28 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms