Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf3Q9QXK7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf3Q9QXK7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf3Q9QXK7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cpsf3Q9QXK7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cpsf3Q9QXK7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms