Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ChmQ9QXG2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ChmQ9QXG2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms