Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trpc5Q9QX29 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trpc5Q9QX29 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms