Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkd2l2Q9JLG4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms