Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx6Q9JKK1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx6Q9JKK1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms