Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJL8

Sars2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sars2Q9JJL8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sars2Q9JJL8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Sars2Q9JJL8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sars2Q9JJL8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms