Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc52a2Q9D8F3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc52a2Q9D8F3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms